淠河湿地生态系统由河流湿地（淠河）、水田、池塘等生态系统类型组成。淠河源出大别山区，流经淮河流域丘陵平原，属于北亚热带向暖温带转换的过渡带。季风显著，四季分明，气候温和，雨量充沛，光照充足，无霜期长，适宜湿地植物及鸟类、鱼类、底栖动物等生长繁殖。

淠河水浅底平，河底为淤泥底质。湿地内部景观结构变化从中央向外围依次为开敞水面、泥沙滩地、草滩地。其中草滩地景观特征典型，发育面积广泛，生长着六安地区典型的挺水植被带和水生植被带。随着季节性的水位变化，湿地公园内的湿地植物群落出现更替变换。农田、漫滩和小岛为珍稀水禽提供了重要栖息地；河流及周边池塘为鱼类和底栖动物提供了繁育场所。

湿地动物

淠河国家湿地公园地处江淮丘陵平原区，地势起伏不大，农耕发达，人口密集，不具备适合大型兽类栖息的生境。本次调查共统计淠河湿地分布兽类5目8科19种；鱼类5目11科30种；其中两栖类5科15种；爬行类2目8科26种；鸟类14目34科129种，且国家重点保护鸟类17种，有中华秋沙鸭、东方白鹳、小天鹅、白琵鹭、鸳鸯等。

湿地植物

根据调查与资料整理分析结果，淠河国家湿地公园植物资源包括浮游植物和维管植物。根据调查与资料整理共统计淠河湿地分布维管束植物有96科298种，其中国家重点保护植物有野大豆、野菱、金荞麦等8种为国家二级（含）以上重点保护植物。优势物种主要有莎草科、蓼科、禾本科等植物。